Homo sapiens Protein: PRPF31 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-68112.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PRPF31 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | PRP31 pre-mRNA processing factor 31 homolog (S. cerevisiae) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000324122 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-68110 (PRPF31) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Involved in pre-mRNA splicing. Required for the assembly of the U4/U5/U6 tri-snRNP complex, one of the building blocks of the spliceosome. {ECO:0000269PubMed:11867543}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus speckle. Nucleus, Cajal body. Note=Predominantly found in speckles and in Cajal bodies. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | Retinitis pigmentosa 11 (RP11) [MIM:600138]: A retinal dystrophy belonging to the group of pigmentary retinopathies. Retinitis pigmentosa is characterized by retinal pigment deposits visible on fundus examination and primary loss of rod photoreceptor cells followed by secondary loss of cone photoreceptors. Patients typically have night vision blindness and loss of midperipheral visual field. As their condition progresses, they lose their far peripheral visual field and eventually central vision as well. {ECO:0000269PubMed:11545739, ECO:0000269PubMed:12923864, ECO:0000269PubMed:8808602}. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry. | ||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Ubiquitously expressed. {ECO:0000269PubMed:11545739}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 62 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR002687
Nop domain IPR012976 NOSIC IPR019175 Prp31 C-terminal |
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PFAM |
PF01798
PF08060 PF09785 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00931
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q8WWY3 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q8WWY3 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | F1T0A5 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 26121 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_056444 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:15446 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 606419 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS12879 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 05917 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AB593025 AC012314 AF308303 AK098547 AL050369 AY040822 BC117389 CH471135 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAG48270 AAI17390 AAK77986 BAC05329 BAJ83979 CAB43677 EAW72190 | ||||||||||||||||||||||