Version 5.4
| Bos taurus Protein: RAB39B | |||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||
| InnateDB Protein | IDBP-683662.2 | ||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
| Gene Symbol | RAB39B | ||||||||||||||||||
| Protein Name | Ras-related protein Rab-39B | ||||||||||||||||||
| Synonyms | |||||||||||||||||||
| Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||
| Ensembl Protein | ENSBTAP00000026354 | ||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-632078 (RAB39B) | ||||||||||||||||||
| Protein Structure |
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| UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
| Function | May be involved in vesicular trafficking. Plays a role in synapse formation. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||
| Subcellular Localization | Cell membrane {ECO:0000305}; Lipid-anchor {ECO:0000305}; Cytoplasmic side {ECO:0000305}. Golgi apparatus {ECO:0000250}. Note=Partial colocalization with markers that cycle from the cell surface to the trans-Golgi network. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||
| Disease Associations | |||||||||||||||||||
| Tissue Specificity | |||||||||||||||||||
| Comments | |||||||||||||||||||
| Interactions | |||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 3 interaction(s) predicted by orthology.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
| PDB ID | |||||||||||||||||||
| InterPro |
IPR001806
Small GTPase superfamily IPR002041 Ran GTPase IPR003578 Small GTPase superfamily, Rho type IPR003579 Small GTPase superfamily, Rab type IPR005225 Small GTP-binding protein domain IPR006689 Small GTPase superfamily, ARF/SAR type IPR006762 Gtr1/RagA G protein IPR013684 Mitochondrial Rho-like IPR020849 Small GTPase superfamily, Ras type IPR027417 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase |
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| PFAM |
PF00071
PF00025 PF04670 PF08477 |
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| PRINTS |
PR00449
PR00627 PR00328 |
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| PIRSF | |||||||||||||||||||
| SMART |
SM00176
SM00174 SM00175 SM00173 |
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| TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
| Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
| Modification | |||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||
| SwissProt | Q17QU4 | ||||||||||||||||||
| PhosphoSite | PhosphoSite- | ||||||||||||||||||
| TrEMBL | |||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
| Entrez Gene | 537560 | ||||||||||||||||||
| UniGene | Bt.55967 | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_001069563 | ||||||||||||||||||
| HUGO | |||||||||||||||||||
| OMIM | |||||||||||||||||||
| CCDS | |||||||||||||||||||
| HPRD | |||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||
| EMBL | BC118177 | ||||||||||||||||||
| GenPept | AAI18178 | ||||||||||||||||||