Bos taurus Protein: VDR | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-684670.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | VDR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | Vitamin D3 receptor | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSBTAP00000021832 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-633008 (VDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Nuclear hormone receptor. Transcription factor that mediates the action of vitamin D3 by controlling the expression of hormone sensitive genes. Regulates transcription of hormone sensitive genes via its association with the WINAC complex, a chromatin-remodeling complex. Recruited to promoters via its interaction with the WINAC complex subunit BAZ1B/WSTF, which mediates the interaction with acetylated histones, an essential step for VDR-promoter association. Plays a central role in calcium homeostasis (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000255PROSITE- ProRule:PRU00407}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Mammary gland, expression increases during lactation. Also found in colon, expression is down-regulated at parturition. {ECO:0000269PubMed:6250480, ECO:0000269PubMed:8747330}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 100 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000324
Vitamin D receptor IPR000536 Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core IPR001628 Zinc finger, nuclear hormone receptor-type IPR001723 Steroid hormone receptor IPR008946 Nuclear hormone receptor, ligand-binding |
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PFAM |
PF00104
PF00105 |
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PRINTS |
PR00350
PR00047 PR00398 |
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00430
SM00399 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q28037 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite- | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q19MM0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 533656 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.61412 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001161404 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AAFC03056593 DAAA02012986 DQ519355 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | ABF68772 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||