Bos taurus Protein: HNRNPK | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-688034.2 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | HNRNPK | ||||||||||||||||||||||||
Protein Name | Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | HNRPK; | ||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSBTAP00000028162 | ||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-636114 (HNRNPK) | ||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||
Function | One of the major pre-mRNA-binding proteins. Binds tenaciously to poly(C) sequences. Likely to play a role in the nuclear metabolism of hnRNAs, particularly for pre-mRNAs that contain cytidine-rich sequences. Can also bind poly(C) single- stranded DNA. Plays an important role in p53/TP53 response to DNA damage, acting at the level of both transcription activation and repression. When sumoylated, acts as a transcriptional coactivator of p53/TP53, playing a role in p21/CDKN1A and 14-3-3 sigma/SFN induction. As far as transcription repression is concerned, acts by interacting with long intergenic RNA p21 (lincRNA-p21), a non- coding RNA induced by p53/TP53. This interaction is necessary for the induction of apoptosis, but not cell cycle arrest (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm {ECO:0000250}. Nucleus, nucleoplasm {ECO:0000250}. Cell projection, podosome {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 161 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR004087
K Homology domain IPR004088 K Homology domain, type 1 IPR012987 ROK, N-terminal |
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PFAM |
PF00013
PF13014 PF08067 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00322
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q3T0D0 | ||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite- | ||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 528135 | ||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.69550 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001029734 | ||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
EMBL | BC102450 | ||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI02451 | ||||||||||||||||||||||||