Bos taurus Protein: SNX17 | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-688604.2 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SNX17 | ||||||||||||||||||||||||
Protein Name | Sorting nexin-17 | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSBTAP00000025998 | ||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-636654 (SNX17) | ||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||
Function | Critical regulator of endosomal recycling of numerous receptors, channels, and other transmembrane proteins. Binds to NPxY sequences in the cytoplasmic tails of target cargos. Plays a role in the sorting of endocytosed LRP1 and APP, and prevents their degradation. Required for maintenance of normal cell surface levels of APP and LRP1. Recycles internalized integrins ITGB1, ITGB5 and their associated alpha subunits, preventing them from lysosomal degradation. Interacts with membranes containing phosphatidylinositol 3-phosphate (PtdIns(3P)) (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm {ECO:0000250}. Early endosome {ECO:0000250}. Cytoplasmic vesicle membrane {ECO:0000250}; Peripheral membrane protein {ECO:0000250}; Cytoplasmic side {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 18 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000159
Ras-association IPR001683 Phox homologous domain IPR019748 FERM central domain IPR029071 Ubiquitin-related domain |
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PFAM |
PF00788
PF00787 PF00373 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00314
SM00312 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q5EA77 | ||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite- | ||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 529972 | ||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.97079 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001015638 | ||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
EMBL | BC118249 BT020692 | ||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI18250 AAX08709 | ||||||||||||||||||||||||