Bos taurus Protein: RABGEF1 | |||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-691975.2 | ||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RABGEF1 | ||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | Rab5 GDP/GTP exchange factor | ||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | RABEX5; | ||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSBTAP00000005011 | ||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-639781 (RABGEF1) | ||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||
Function | Rab effector protein acting as linker between gamma- adaptin and RAB5A. Involved in endocytic membrane fusion and membrane trafficking of recycling endosomes. Stimulates nucleotide exchange on RAB5A. Can act as a ubiquitin ligase. {ECO:0000269PubMed:16462746, ECO:0000269PubMed:9323142}. | ||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm {ECO:0000269PubMed:9323142}. Early endosome {ECO:0000269PubMed:9323142}. Recycling endosome {ECO:0000269PubMed:9323142}. | ||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Detected in brain. {ECO:0000269PubMed:9323142}. | ||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 13 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 10 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR002653
Zinc finger, A20-type IPR003123 Vacuolar sorting protein 9 IPR013995 Vacuolar sorting protein 9, subgroup |
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PFAM |
PF01754
PF02204 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00259
SM00167 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | O18973 | ||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite- | ||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q2TBX8 | ||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 282335 | ||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.317 | ||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_777016 | ||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AJ001119 BC109491 DAAA02057950 | ||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI09492 CAA04545 | ||||||||||||||||||||||||||||