Bos taurus Protein: FEN1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-696080.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | FEN1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | Flap endonuclease 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSBTAP00000000071 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-643523 (FEN1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Structure-specific nuclease with 5'-flap endonuclease and 5'-3' exonuclease activities involved in DNA replication and repair. During DNA replication, cleaves the 5'-overhanging flap structure that is generated by displacement synthesis when DNA polymerase encounters the 5'-end of a downstream Okazaki fragment. It enters the flap from the 5'-end and then tracks to cleave the flap base, leaving a nick for ligation. Also involved in the long patch base excision repair (LP-BER) pathway, by cleaving within the apurinic/apyrimidinic (AP) site-terminated flap. Acts as a genome stabilization factor that prevents flaps from equilibrating into structurs that lead to duplications and deletions. Also possesses 5'-3' exonuclease activity on nicked or gapped double- stranded DNA, and exhibits RNase H activity. Also involved in replication and repair of rDNA and in repairing mitochondrial DNA. {ECO:0000255HAMAP-Rule:MF_03140, ECO:0000269PubMed:8288581, ECO:0000269PubMed:8530463, ECO:0000269PubMed:8703932}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus, nucleolus {ECO:0000255HAMAP- Rule:MF_03140}. Nucleus, nucleoplasm {ECO:0000255HAMAP- Rule:MF_03140}. Mitochondrion {ECO:0000255HAMAP-Rule:MF_03140}. Note=Resides mostly in the nucleoli and relocalizes to the nucleoplasm upon DNA damage. {ECO:0000255HAMAP-Rule:MF_03140}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 26 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR006085
XPG N-terminal IPR006086 XPG-I domain IPR008918 Helix-hairpin-helix motif, class 2 IPR020045 5\'-3\' exonuclease, C-terminal domain IPR029060 PIN domain-like |
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PFAM |
PF00752
PF00867 PF01367 PF09293 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00485
SM00484 SM00279 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q58DH8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite- | ||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 616242 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.10503 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001030285 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | BC105255 BT021527 BT021540 BT021619 BT021755 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI05256 AAX46374 AAX46387 AAX46466 AAX46602 | ||||||||||||||||||||||||||||||||