Homo sapiens Protein: HNRNPK | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-73950.7 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | HNRNPK | ||||||||||||||||||||||||
Protein Name | heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | CSBP; HNRPK; TUNP; | ||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000365458 | ||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-73948 (HNRNPK) | ||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||
Function | One of the major pre-mRNA-binding proteins. Binds tenaciously to poly(C) sequences. Likely to play a role in the nuclear metabolism of hnRNAs, particularly for pre-mRNAs that contain cytidine-rich sequences. Can also bind poly(C) single- stranded DNA. Plays an important role in p53/TP53 response to DNA damage, acting at the level of both transcription activation and repression. When sumoylated, acts as a transcriptional coactivator of p53/TP53, playing a role in p21/CDKN1A and 14-3-3 sigma/SFN induction (By similarity). As far as transcription repression is concerned, acts by interacting with long intergenic RNA p21 (lincRNA-p21), a non-coding RNA induced by p53/TP53. This interaction is necessary for the induction of apoptosis, but not cell cycle arrest. {ECO:0000250, ECO:0000269PubMed:16360036, ECO:0000269PubMed:20673990, ECO:0000269PubMed:22825850}. | ||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm. Nucleus, nucleoplasm. Cell projection, podosome. Note=Recruited to p53/TP53-responsive promoters, in the presence of functional p53/TP53. In case of ASFV infection, there is a shift in the localization which becomes predominantly nuclear. | ||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 279 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 7 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR004087
K Homology domain IPR004088 K Homology domain, type 1 IPR012987 ROK, N-terminal |
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PFAM |
PF00013
PF13014 PF08067 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00322
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P61978 | ||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P61978 | ||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q6IBN1 | ||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 3190 | ||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.729980 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_002131 | ||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:5044 | ||||||||||||||||||||||||
OMIM | 600712 | ||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS6668 | ||||||||||||||||||||||||
HPRD | 02834 | ||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB209562 AB451263 AB451390 AK291336 AL354733 BC000355 BC014980 CH471089 CR456771 S74678 X72727 | ||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAB20770 AAH00355 AAH14980 BAD92799 BAF84025 BAG70077 BAG70204 CAA51267 CAG33052 CAI16020 EAW62675 EAW62677 | ||||||||||||||||||||||||