Homo sapiens Protein: PABPC5 | |||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-78807.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | PABPC5 | ||||||||||||||||||
Protein Name | poly(A) binding protein, cytoplasmic 5 | ||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000308012 | ||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-78803 (PABPC5) | ||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
Function | Binds the poly(A) tail of mRNA. May be involved in cytoplasmic regulatory processes of mRNA metabolism. Can probably bind to cytoplasmic RNA sequences other than poly(A) in vivo (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm {ECO:0000250}.Isoform 2: Mitochondrion matrix {ECO:0000269PubMed:23275553}. Note=Co-fractionates with mtDNA and co-immunoprecipitates with the mitochondrial poly(A) polymerase. | ||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed in fetal brain and in a range of adult tissues. | ||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
|
||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||
Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000504
RNA recognition motif domain IPR003954 RNA recognition motif domain, eukaryote IPR006515 Polyadenylate binding protein, human types 1, 2, 3, 4 |
||||||||||||||||||
PFAM |
PF00076
|
||||||||||||||||||
PRINTS | |||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||
SMART |
SM00360
SM00361 |
||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | Q96DU9 | ||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q96DU9 | ||||||||||||||||||
TrEMBL | Q5JQF3 | ||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 140886 | ||||||||||||||||||
UniGene | Hs.246590 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NP_543022 | ||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:13629 | ||||||||||||||||||
OMIM | 300407 | ||||||||||||||||||
CCDS | CCDS14460 | ||||||||||||||||||
HPRD | 02324 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | AJ278963 AK290105 AK297327 AL122118 AL662874 BC063113 CH471115 | ||||||||||||||||||
GenPept | AAH63113 BAF82794 BAG59787 CAB59276 CAC42826 CAI41475 EAX02776 | ||||||||||||||||||