Homo sapiens Protein: SNRPC | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-83696.7 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SNRPC | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | small nuclear ribonucleoprotein polypeptide C | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | U1C; Yhc1; | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000363129 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-83690 (SNRPC) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Component of the spliceosomal U1 snRNP, which is essential for recognition of the pre-mRNA 5' splice-site and the subsequent assembly of the spliceosome. SNRPC/U1-C is directly involved in initial 5' splice-site recognition for both constitutive and regulated alternative splicing. The interaction with the 5' splice-site seems to precede base-pairing between the pre-mRNA and the U1 snRNA. Stimulates E complex formation by stabilizing the base pairing of the 5' end of the U1 snRNA and the 5' splice-site region. {ECO:0000269PubMed:1826349, ECO:0000269PubMed:2136774, ECO:0000269PubMed:8798632}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 71 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000690
Zinc finger, C2H2-type matrin IPR003604 Zinc finger, U1-type IPR013085 Zinc finger, U1-C type IPR017340 U1 small nuclear ribonucleoprotein C |
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PFAM |
PF06220
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF |
PIRSF037969
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SMART |
SM00451
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P09234 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q5TAL2 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 6631 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.601639 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | |||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:11157 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 603522 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||
HPRD | 04630 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AL139100 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||