Homo sapiens Protein: ABL1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-89601.7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | ABL1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | c-abl oncogene 1, non-receptor tyrosine kinase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | ABL; bcr/abl; c-ABL; c-ABL1; JTK7; p150; v-abl; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000361423 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-89599 (ABL1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Non-receptor tyrosine-protein kinase that plays a role in many key processes linked to cell growth and survival such as cytoskeleton remodeling in response to extracellular stimuli, cell motility and adhesion, receptor endocytosis, autophagy, DNA damage response and apoptosis. Coordinates actin remodeling through tyrosine phosphorylation of proteins controlling cytoskeleton dynamics like WASF3 (involved in branch formation); ANXA1 (involved in membrane anchoring); DBN1, DBNL, CTTN, RAPH1 and ENAH (involved in signaling); or MAPT and PXN (microtubule-binding proteins). Phosphorylation of WASF3 is critical for the stimulation of lamellipodia formation and cell migration. Involved in the regulation of cell adhesion and motility through phosphorylation of key regulators of these processes such as BCAR1, CRK, CRKL, DOK1, EFS or NEDD9. Phosphorylates multiple receptor tyrosine kinases and more particularly promotes endocytosis of EGFR, facilitates the formation of neuromuscular synapses through MUSK, inhibits PDGFRB-mediated chemotaxis and modulates the endocytosis of activated B-cell receptor complexes. Other substrates which are involved in endocytosis regulation are the caveolin (CAV1) and RIN1. Moreover, ABL1 regulates the CBL family of ubiquitin ligases that drive receptor down-regulation and actin remodeling. Phosphorylation of CBL leads to increased EGFR stability. Involved in late-stage autophagy by regulating positively the trafficking and function of lysosomal components. ABL1 targets to mitochondria in response to oxidative stress and thereby mediates mitochondrial dysfunction and cell death. ABL1 is also translocated in the nucleus where it has DNA-binding activity and is involved in DNA-damage response and apoptosis. Many substrates are known mediators of DNA repair: DDB1, DDB2, ERCC3, ERCC6, RAD9A, RAD51, RAD52 or WRN. Activates the proapoptotic pathway when the DNA damage is too severe to be repaired. Phosphorylates TP73, a primary regulator for this type of damage- induced apoptosis. Phosphorylates the caspase CASP9 on 'Tyr-153' and regulates its processing in the apoptotic response to DNA damage. Phosphorylates PSMA7 that leads to an inhibition of proteasomal activity and cell cycle transition blocks. ABL1 acts also as a regulator of multiple pathological signaling cascades during infection. Several known tyrosine-phosphorylated microbial proteins have been identified as ABL1 substrates. This is the case of A36R of Vaccinia virus, Tir (translocated intimin receptor) of pathogenic E.coli and possibly Citrobacter, CagA (cytotoxin- associated gene A) of H.pylori, or AnkA (ankyrin repeat-containing protein A) of A.phagocytophilum. Pathogens can highjack ABL1 kinase signaling to reorganize the host actin cytoskeleton for multiple purposes, like facilitating intracellular movement and host cell exit. Finally, functions as its own regulator through autocatalytic activity as well as through phosphorylation of its inhibitor, ABI1. {ECO:0000269PubMed:10391250, ECO:0000269PubMed:11971963, ECO:0000269PubMed:12379650, ECO:0000269PubMed:12531427, ECO:0000269PubMed:12672821, ECO:0000269PubMed:15031292, ECO:0000269PubMed:15556646, ECO:0000269PubMed:15657060, ECO:0000269PubMed:15886098, ECO:0000269PubMed:16424036, ECO:0000269PubMed:16678104, ECO:0000269PubMed:16943190, ECO:0000269PubMed:17306540, ECO:0000269PubMed:17623672, ECO:0000269PubMed:18328268, ECO:0000269PubMed:18945674, ECO:0000269PubMed:19891780, ECO:0000269PubMed:20357770, ECO:0000269PubMed:20417104, ECO:0000269PubMed:9037071, ECO:0000269PubMed:9144171, ECO:0000269PubMed:9461559}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm, cytoskeleton. Nucleus. Mitochondrion {ECO:0000250}. Note=Shuttles between the nucleus and cytoplasm depending on environmental signals. Sequestered into the cytoplasm through interaction with 14-3-3 proteins. Localizes to mitochondria in response to oxidative stress (By similarity). {ECO:0000250}.Isoform IB: Nucleus membrane; Lipid-anchor. Note=The myristoylated c-ABL protein is reported to be nuclear. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | Leukemia, chronic myeloid (CML) [MIM:608232]: A clonal myeloproliferative disorder of a pluripotent stem cell with a specific cytogenetic abnormality, the Philadelphia chromosome (Ph), involving myeloid, erythroid, megakaryocytic, B-lymphoid, and sometimes T-lymphoid cells, but not marrow fibroblasts. Note=The gene represented in this entry is involved in disease pathogenesis.Note=A chromosomal aberration involving ABL1 has been found in patients with chronic myeloid leukemia. Translocation t(9;22)(q34;q11) with BCR. The translocation produces a BCR-ABL found also in acute myeloid leukemia (AML) and acute lymphoblastic leukemia (ALL). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Widely expressed. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 266 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 29 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000719
Protein kinase domain IPR000980 SH2 domain IPR001245 Serine-threonine/tyrosine-protein kinase catalytic domain IPR001452 SH3 domain IPR002290 Serine/threonine/dual specificity protein kinase, catalytic domain IPR011009 Protein kinase-like domain IPR011511 Variant SH3 domain IPR015015 F-actin binding IPR020635 Tyrosine-protein kinase, catalytic domain |
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PFAM |
PF00069
PF00017 PF14633 PF07714 PF00018 PF14604 PF07653 PF08919 |
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PRINTS |
PR00401
PR00109 PR00452 |
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00252
SM00326 SM00220 SM00808 SM00219 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P00519 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P00519 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q59FK4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.431048 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_009297 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:76 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 189980 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS35165 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 01809 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB209456 AL161733 AL359092 BC117451 CH471090 DQ145721 KJ420609 M14752 S69223 U07561 U07563 X16416 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA51561 AAB60393 AAB60394 AAD14034 AAI17452 AAZ38718 AHX39209 BAD92693 CAA34438 CAM45752 CAM45754 CAM45756 EAW87948 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||