Homo sapiens Protein: CACNA1B | |||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-93623.5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | CACNA1B | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | calcium channel, voltage-dependent, N type, alpha 1B subunit | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | BIII; CACNL1A5; CACNN; Cav2.2; | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000360423 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-93621 (CACNA1B) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Voltage-sensitive calcium channels (VSCC) mediate the entry of calcium ions into excitable cells and are also involved in a variety of calcium-dependent processes, including muscle contraction, hormone or neurotransmitter release, gene expression, cell motility, cell division and cell death. The isoform alpha-1B gives rise to N-type calcium currents. N-type calcium channels belong to the 'high-voltage activated' (HVA) group and are blocked by omega-conotoxin-GVIA (omega-CTx-GVIA) and by omega-agatoxin- IIIA (omega-Aga-IIIA). They are however insensitive to dihydropyridines (DHP), and omega-agatoxin-IVA (omega-Aga-IVA). Calcium channels containing alpha-1B subunit may play a role in directed migration of immature neurons. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Membrane; Multi-pass membrane protein. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Isoform Alpha-1b-1 and isoform Alpha-1b-2 are expressed in the central nervous system, but not in skeletal muscle or aorta. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 11 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR002048
EF-hand domain IPR002077 Voltage-dependent calcium channel, alpha-1 subunit IPR003915 Polycystic kidney disease type 2 protein IPR005447 Voltage-dependent calcium channel, N-type, alpha-1 subunit IPR005821 Ion transport domain IPR013122 Polycystin cation channel, PKD1/PKD2 IPR014873 Voltage-dependent calcium channel, alpha-1 subunit, IQ domain |
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PFAM |
PF00036
PF13202 PF13405 PF00520 PF08016 PF08763 |
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PRINTS |
PR00167
PR01433 PR01631 |
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00054
SM01062 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q00975 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q00975 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q9HBI3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 774 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.495522 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_000709 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:1389 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 601012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS59522 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 03005 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AF233289 AF237470 AF238295 AF239237 AF245659 AF245660 AF247811 AF302779 AF302780 AF302782 AL591424 AL772363 M94172 M94173 U76666 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA51897 AAA51898 AAC51138 AAG13644 AAG13647 AAG13648 AAG13650 AAG14396 AAG14397 CAI17144 CAI40687 | ||||||||||||||||||||||||||||||||