Homo sapiens Gene: VPS72 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-102316.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | VPS72 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | vacuolar protein sorting 72 homolog (S. cerevisiae) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | CFL1; Swc2; TCFL1; YL-1; YL1 | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000163159 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
vacuolar protein sorting 72 homolog (S. cerevisiae)
vacuolar protein sorting 72 homolog (S. cerevisiae)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is a shared subunit of two multi-component complexes, the histone acetyltransferase complex TRRAP/TIP60 as well as the chromatin remodeling SRCAP-containing complex. The TRRAP/TIP60 complex acetylates nucleosomal histones important for transcriptional regulation, double strand DNA break repair and apoptosis. The SRCAP-containing complex catalyzes the exchange of histone H2A with the histone variant Htz1 (H2AFZ) into nucleosomes. This protein may be responsible for binding H2AFZ, which has a role in chromosome segregation. This protein may also have a role in regulating long-term hematopoietic stem cell activity. Alternative splicing results in multiple transcript variants that encode different protein isoforms. [provided by RefSeq, Aug 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:151169987-151195321 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q21.3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 23 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
HATs acetylate histones pathway
Chromatin organization pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q15906 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 6944 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001271087 NM_001271088 NM_005997 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:11644 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 600607 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS59201 CCDS989 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 02791 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AK222935 AK222939 AL592424 BC003151 BT019356 BT019357 CH471121 CX163016 D43642 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH03151 AAV38163 AAV38164 BAA07757 BAD96655 BAD96659 CAI16385 EAW53462 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 6944 | ||||||||||||||||||||||