Homo sapiens Gene: SLC6A3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-11161.5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SLC6A3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, dopamine), member 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | DAT; DAT1; PKDYS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000142319 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, dopamine), member 3
solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, dopamine), member 3
solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, dopamine), member 3
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a dopamine transporter which is a member of the sodium- and chloride-dependent neurotransmitter transporter family. The 3' UTR of this gene contains a 40 bp tandem repeat, referred to as a variable number tandem repeat or VNTR, which can be present in 3 to 11 copies. Variation in the number of repeats is associated with idiopathic epilepsy, attention-deficit hyperactivity disorder, dependence on alcohol and cocaine, susceptibility to Parkinson disease and protection against nicotine dependence.[provided by RefSeq, Nov 2009] This gene encodes a dopamine transporter which is a member of the sodium- and chloride-dependent neurotransmitter transporter family. The 3\' UTR of this gene contains a 40 bp tandem repeat, referred to as a variable number tandem repeat or VNTR, which can be present in 3 to 11 copies. Variation in the number of repeats is associated with idiopathic epilepsy, attention-deficit hyperactivity disorder, dependence on alcohol and cocaine, susceptibility to Parkinson disease and protection against nicotine dependence.[provided by RefSeq, Nov 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:1392790-1445430 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p15.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 25 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 5 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Na+/Cl- dependent neurotransmitter transporters pathway
Transport of glucose and other sugars, bile salts and organic acids, metal ions and amine compounds pathway
Dopamine clearance from the synaptic cleft pathway
Neurotransmitter Clearance In The Synaptic Cleft pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Neuronal System pathway
Transmission across Chemical Synapses pathway
SLC-mediated transmembrane transport pathway
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KEGG |
Parkinson's disease pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Alpha-synuclein signaling
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.406 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001044 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS3863 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 00543 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||