Homo sapiens Gene: CLDN6 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-11315.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | CLDN6 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | claudin 6 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000184697 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
claudin 6
claudin 6
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
Tight junctions represent one mode of cell-to-cell adhesion in epithelial or endothelial cell sheets, forming continuous seals around cells and serving as a physical barrier to prevent solutes and water from passing freely through the paracellular space. These junctions are comprised of sets of continuous networking strands in the outwardly facing cytoplasmic leaflet, with complementary grooves in the inwardly facing extracytoplasmic leaflet. This gene encodes a component of tight junction strands, which is a member of the claudin family. The protein is an integral membrane protein and is one of the entry cofactors for hepatitis C virus. The gene methylation may be involved in esophageal tumorigenesis. This gene is adjacent to another family member CLDN9 on chromosome 16.[provided by RefSeq, Aug 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 16:3014712-3020071 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | p13.3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Tight junction interactions pathway
Cell-Cell communication pathway
Cell junction organization pathway
Cell-cell junction organization pathway
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KEGG |
Cell adhesion molecules (CAMs) pathway
Leukocyte transendothelial migration pathway
Tight junction pathway
Hepatitis C pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | P56747 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 9074 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.533779 Hs.690156 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_021195 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:2048 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 615798 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS10488 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 13070 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AF125306 AJ249735 AK075329 AY358480 BC008934 BT007399 CH471112 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH08934 AAK02013 AAP36063 AAQ88844 BAG52111 CAB56533 EAW85431 EAW85432 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 9074 | ||||||||||||||||||||||