Mus musculus Gene: T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-135749.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | brachyury | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Bra; cou; D17Mit170; Low; Lr; me75; T1; Tl2; Tl3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000062327 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
brachyury
brachyury
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000164458:
The protein encoded by this gene is an embryonic nuclear transcription factor that binds to a specific DNA element, the palindromic T-site. It binds through a region in its N-terminus, called the T-box, and effects transcription of genes required for mesoderm formation and differentiation. The protein is localized to notochord-derived cells. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 17:8434423-8442496 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | A1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Regulation of nuclear beta catenin signaling and target gene transcription
Validated transcriptional targets of deltaNp63 isoforms
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | D3Z1X4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 20997 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.913 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_009309 XM_006523301 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS28383 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:98472 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC154579 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 20997 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||