Homo sapiens Gene: RORA | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-14920.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RORA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | RAR-related orphan receptor A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | NR1F1; ROR1; ROR2; ROR3; RZR-ALPHA; RZRA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000069667 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
RAR-related orphan receptor A
RAR-related orphan receptor A
RAR-related orphan receptor A
RAR-related orphan receptor A
RAR-related orphan receptor A
RAR-related orphan receptor A
RAR-related orphan receptor A
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The transcription factor RORA is critical for the development of nuocytes and the mounting of innate type 2 immunity against parasitic worms. (Demonstrated in mice)
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InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Mus musculus] The transcription factor Rora is critical for the development of nuocytes and the mounting of innate type 2 immunity against parasitic worms.
[Mus musculus] Nlrp3 is a novel molecular target for melatonin which requires Rora to blunt the NFkB/ NLRP3 connection during sepsis.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is a member of the NR1 subfamily of nuclear hormone receptors. It can bind as a monomer or as a homodimer to hormone response elements upstream of several genes to enhance the expression of those genes. The specific functions of this protein are not known, but it has been shown to interact with NM23-2, a nucleoside diphosphate kinase involved in organogenesis and differentiation, as well as with NM23-1, the product of a tumor metastasis suppressor candidate gene. Four transcript variants encoding different isoforms have been described for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] The protein encoded by this gene is a member of the NR1 subfamily of nuclear hormone receptors. It can bind as a monomer or as a homodimer to hormone response elements upstream of several genes to enhance the expression of those genes. The encoded protein has been shown to interact with NM23-2, a nucleoside diphosphate kinase involved in organogenesis and differentiation, as well as with NM23-1, the product of a tumor metastasis suppressor candidate gene. Also, it has been shown to aid in the transcriptional regulation of some genes involved in circadian rhythm. Four transcript variants encoding different isoforms have been described for this gene. [provided by RefSeq, Feb 2014] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 15:60488284-61229319 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q22.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 40 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
PPARA activates gene expression pathway
Regulation of lipid metabolism by Peroxisome proliferator-activated receptor alpha (PPARalpha) pathway
Fatty acid, triacylglycerol, and ketone body metabolism pathway
RORA activates circadian gene expression pathway
BMAL1:CLOCK,NPAS2 activates circadian gene expression pathway
REV-ERBA represses gene expression pathway
Circadian Clock pathway
Nuclear Receptor transcription pathway pathway
Generic Transcription Pathway pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Metabolism pathway
Gene Expression pathway
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KEGG |
Circadian rhythm pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
HIF-1-alpha transcription factor network
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.560343 Hs.625932 Hs.691779 Hs.718317 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_002943 NM_134260 NM_134261 NM_134262 XM_005254584 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS10177 CCDS10178 CCDS10179 CCDS45271 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 02896 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||