Homo sapiens Gene: DDX56 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-14952.7 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | DDX56 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 56 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000136271 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 56
DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 56
DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 56
DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 56
DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 56
DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 56
DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 56
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a member of the DEAD box protein family. DEAD box proteins, characterized by the conserved motif Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD), are putative RNA helicases. They are implicated in a number of cellular processes involving alteration of RNA secondary structure such as translation initiation, nuclear and mitochondrial splicing, and ribosome and spliceosome assembly. Based on their distribution patterns, some members of this family are believed to be involved in embryogenesis, spermatogenesis, and cellular growth and division. The protein encoded by this gene shows ATPase activity in the presence of polynucleotides and associates with nucleoplasmic 65S preribosomal particles. This gene may be involved in ribosome synthesis, most likely during assembly of the large 60S ribosomal subunit. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Mar 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 7:44565417-44575051 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | p13 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 44 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | F8WDT8 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 54606 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.654762 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001257189 NM_019082 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:18193 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 608023 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS5492 CCDS59053 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 12154 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AC004938 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 54606 | ||||||||||||||||||||||