Mus musculus Gene: Plrg1 | |||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-154656.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Plrg1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | pleiotropic regulator 1, PRL1 homolog (Arabidopsis) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | AA958940; C80566; Tango4 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000027998 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
pleiotropic regulator 1, PRL1 homolog (Arabidopsis)
pleiotropic regulator 1, PRL1 homolog (Arabidopsis)
pleiotropic regulator 1, PRL1 homolog (Arabidopsis)
|
||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000171566:
This gene encodes a core component of the cell division cycle 5-like (CDC5L) complex. The CDC5L complex is part of the spliceosome and is required for pre-mRNA splicing. The encoded protein plays a critical role in alternative splice site selection. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Jan 2011] |
||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 3:83055522-83072355 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | E3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 9 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 28 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
mRNA Splicing pathway
Gene Expression pathway
mRNA Splicing - Major Pathway pathway
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA pathway
|
||||||||||||||||||||||
KEGG |
Spliceosome pathway
|
||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
mRNA Splicing - Major Pathway pathway
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA pathway
mRNA Splicing pathway
Gene Expression pathway
mRNA Splicing - Major Pathway pathway
mRNA Splicing pathway
Gene Expression pathway
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA pathway
|
||||||||||||||||||||||
KEGG |
Spliceosome pathway
|
||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | F8WI31 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 53317 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.286349 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_016784 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS17433 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1858197 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Plrg1 | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AC138394 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 53317 | ||||||||||||||||||||||