Mus musculus Gene: Kdm3a | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-155780.6 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Kdm3a | ||||||||||||||||||||||||
Gene Name | lysine (K)-specific demethylase 3A | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 1700105C21Rik; C230043E16Rik; JHDM2a; Jmjd1; Jmjd1a; KDM2A; TGSA; Tsga | ||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000053470 | ||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
lysine (K)-specific demethylase 3A
lysine (K)-specific demethylase 3A
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000115548:
This gene encodes a zinc finger protein that contains a jumonji domain and may play a role in hormone-dependent transcriptional activation. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Apr 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 6:71588974-71632905 | ||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||
Band | C1 | ||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 13 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Chromatin organization pathway
HDMs demethylate histones pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
AndrogenReceptor pathway
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REACTOME |
HDMs demethylate histones pathway
Chromatin organization pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Coregulation of Androgen receptor activity
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q6PCM1 | ||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | A0JLP7 | ||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 104263 | ||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.260479 Mm.475195 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_173001 XM_006505264 XM_006505265 XM_006505266 XM_006505268 NM_001038695 | ||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS20233 | ||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:98847 | ||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Kdm3a | ||||||||||||||||||||||||
EMBL | AK129204 AK144825 AK166797 BC005725 BC026605 BC031158 BC031200 BC059264 DQ323991 | ||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH05725 AAH26605 AAH31158 AAH31200 AAH59264 ABC54567 BAC98014 BAE26085 BAE39025 | ||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 104263 | ||||||||||||||||||||||||