Homo sapiens Gene: PTPN6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-15719.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PTPN6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | HCP; HCPH; HPTP1C; PTP-1C; SH-PTP1; SHP-1; SHP-1L; SHP1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000111679 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 6
protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 6
protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 6
protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 6
protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 6
protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 6
protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 6
protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 6
protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 6
protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 6
protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 6
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
PTPN6 (SHP-1) normally functions to antagonize the IL-2 signal transduction pathway and human T-lymphotropic virus type I (HTLV-I) infection and oncogenic transformation can lead to loss of SHP-1 expression, resulting in constitutive activation of IL-2 regulated T cell responses.
PTPN6 reversibly associates with the IFN-alpha receptor complex upon IFN stimulation and selectively regulates distinct components of JAK/STAT signal transduction pathways.
PTPN6 specifically downregulates MAP3K7 (TAK1) through dephosphorylation, suppressing inflammatory responses via TAK1 signalling pathways.
PTPN6 promotes TLR- and RIG-I-activated production of type I interferon by inhibiting the kinase IRAK1.
PTPN6 tyrosine phosphatase activity plays a critical role in induction of IL2B production in macrophages in response to TLR ligands.
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InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Mus musculus] Bordetella pertussis CyaA toxin plays a role in evading nitric oxide-mediated killing in macrophages through a cAMP-dependent activation of the Ptpn6 phosphatase.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is a member of the protein tyrosine phosphatase (PTP) family. PTPs are known to be signaling molecules that regulate a variety of cellular processes including cell growth, differentiation, mitotic cycle, and oncogenic transformation. N-terminal part of this PTP contains two tandem Src homolog (SH2) domains, which act as protein phospho-tyrosine binding domains, and mediate the interaction of this PTP with its substrates. This PTP is expressed primarily in hematopoietic cells, and functions as an important regulator of multiple signaling pathways in hematopoietic cells. This PTP has been shown to interact with, and dephosphorylate a wide spectrum of phospho-proteins involved in hematopoietic cell signaling. Multiple alternatively spliced variants of this gene, which encode distinct isoforms, have been reported. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 12:6946468-6961316 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p13.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 169 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 20 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
EGFR1 pathway
KitReceptor pathway
TCR pathway
BCR pathway
IL2 pathway
IL3 pathway
IL4 pathway
IL5 pathway
RANKL pathway
TSLP pathway
Prolactin pathway
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REACTOME |
Growth hormone receptor signaling pathway
Regulation of IFNA signaling pathway
Interferon alpha/beta signaling pathway
Regulation of IFNG signaling pathway
Interferon gamma signaling pathway
Interleukin receptor SHC signaling pathway
Interleukin-3, 5 and GM-CSF signaling pathway
Interleukin-2 signaling pathway
PD-1 signaling pathway
Costimulation by the CD28 family pathway
Platelet sensitization by LDL pathway
Platelet homeostasis pathway
PECAM1 interactions pathway
Cell surface interactions at the vascular wall pathway
Regulation of KIT signaling pathway
Signaling by SCF-KIT pathway
Signal regulatory protein (SIRP) family interactions pathway
Cell-Cell communication pathway
Cytokine Signaling in Immune system pathway
Signal Transduction pathway
Interferon Signaling pathway
Adaptive Immune System pathway
Immune System pathway
Signaling by Interleukins pathway
Hemostasis pathway
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KEGG |
Adherens junction pathway
B cell receptor signaling pathway pathway
T cell receptor signaling pathway pathway
Jak-STAT signaling pathway pathway
Natural killer cell mediated cytotoxicity pathway
Leishmaniasis pathway
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INOH |
IL-4 signaling pathway
JAK STAT pathway and regulation pathway
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PID NCI |
TCR signaling in naïve CD8+ T cells
TCR signaling in naïve CD4+ T cells
EPO signaling pathway
BCR signaling pathway
Signaling events mediated by Stem cell factor receptor (c-Kit)
IL4-mediated signaling events
Signaling events mediated by VEGFR1 and VEGFR2
Posttranslational regulation of adherens junction stability and dissassembly
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | F5H1V7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 5777 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.63489 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_002831 NM_080548 NM_080549 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:9658 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 176883 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS41744 CCDS44820 CCDS44821 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 01475 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | U47924 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 5777 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||