Homo sapiens Gene: PEX5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-16151.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PEX5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | peroxisomal biogenesis factor 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | PBD2A; PBD2B; PTS1-BP; PTS1R; PXR1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000139197 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
peroxisomal biogenesis factor 5
peroxisomal biogenesis factor 5
peroxisomal biogenesis factor 5
peroxisomal biogenesis factor 5
peroxisomal biogenesis factor 5
peroxisomal biogenesis factor 5
peroxisomal biogenesis factor 5
peroxisomal biogenesis factor 5
peroxisomal biogenesis factor 5
peroxisomal biogenesis factor 5
peroxisomal biogenesis factor 5
peroxisomal biogenesis factor 5
peroxisomal biogenesis factor 5
peroxisomal biogenesis factor 5
peroxisomal biogenesis factor 5
peroxisomal biogenesis factor 5
peroxisomal biogenesis factor 5
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The product of this gene binds to the C-terminal PTS1-type tripeptide peroxisomal targeting signal (SKL-type) and plays an essential role in peroxisomal protein import. Peroxins (PEXs) are proteins that are essential for the assembly of functional peroxisomes. The peroxisome biogenesis disorders (PBDs) are a group of genetically heterogeneous autosomal recessive, lethal diseases characterized by multiple defects in peroxisome function. The peroxisomal biogenesis disorders are a heterogeneous group with at least 14 complementation groups and with more than 1 phenotype being observed in cases falling into particular complementation groups. Although the clinical features of PBD patients vary, cells from all PBD patients exhibit a defect in the import of one or more classes of peroxisomal matrix proteins into the organelle. Defects in this gene are a cause of neonatal adrenoleukodystrophy (NALD), a cause of Zellweger syndrome (ZWS) as well as may be a cause of infantile Refsum disease (IRD). Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been identified. [provided by RefSeq, Oct 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 12:7188685-7218574 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p13.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 92 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Peroxisome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | B4E0T2 F5GXX3 F5GYB4 F5GZ41 F5H0L9 F5H205 F5H3X7 F5H432 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 5830 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.567327 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001300789 XM_005253452 NM_000319 NM_001131023 NM_001131024 NM_001131025 NM_001131026 XM_005253455 XM_006719131 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:9719 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 600414 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS73433 CCDS44822 CCDS44823 CCDS44824 CCDS8576 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 02684 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC018653 AK292256 AK302742 AK303515 AK316250 BC010621 CH471116 U19721 X84899 Z48054 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC50103 AAH10621 BAF84945 BAG63957 BAG64544 BAH14621 CAA59324 CAA88131 EAW88671 EAW88672 EAW88674 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 5830 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||