Mus musculus Gene: Srebf2 | |||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-166203.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Srebf2 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | sterol regulatory element binding factor 2 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | AI608257; bHLHd2; lop13; nuc; SREBP-2; SREBP2; SREBP2gc | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000022463 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
sterol regulatory element binding factor 2
|
||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||
Summary |
Srebf2 is a key transcriptional regulator of sterol biosynthesis in lipid metabolism, and Srebp2 protein levels in macrophages are negatively regulated by type I interferon signalling during viral infection.
Mir342 is involved in a novel post-transcriptional viral defence mechanism in IFN-activated macrophages by directly targeting Srebf2, Idi1, Dhcr7 and Sc4mol of the sterol pathway.
|
||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] SREBF2 is a key transcriptional regulator of sterol biosynthesis in lipid metabolism, and SREBP2 protein levels in macrophages are negatively regulated by type I interferon signalling during viral infection. (Demonstrated in murine model)
|
||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
DISCONTINUED: This record was withdrawn by Mouse Genome Informatics (MGI). |
||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 15:82147266-82205376 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | E1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 5 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 58 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Fatty acid, triacylglycerol, and ketone body metabolism pathway
Activation of gene expression by SREBF (SREBP) pathway
Regulation of cholesterol biosynthesis by SREBP (SREBF) pathway
Metabolism pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Regulation of lipid metabolism by Peroxisome proliferator-activated receptor alpha (PPARalpha) pathway
PPARA activates gene expression pathway
|
||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
PPARA activates gene expression pathway
Regulation of lipid metabolism by Peroxisome proliferator-activated receptor alpha (PPARalpha) pathway
Activation of gene expression by SREBF (SREBP) pathway
Regulation of cholesterol biosynthesis by SREBP (SREBF) pathway
Fatty acid, triacylglycerol, and ketone body metabolism pathway
Transcriptional regulation of white adipocyte differentiation pathway
Developmental Biology pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Metabolism pathway
|
||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q3U1N2 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 20788 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.38016 Mm.457595 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_033218 XM_006520685 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS27683 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:107585 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Srebf2 | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AC105358 AF289715 AF374267 AK155857 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAG01859 AAK54763 BAE33463 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 20788 | ||||||||||||||||||||||