Mus musculus Gene: Capns1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-168065.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Capns1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | calpain, small subunit 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | Capa-4; Capa4; Capn4; D7Ertd146e | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000001794 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
calpain, small subunit 1
calpain, small subunit 1
calpain, small subunit 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000126247:
Calpains are a ubiquitous, well-conserved family of calcium-dependent, cysteine proteases. Calpain families have been implicated in neurodegenerative processes, as their activation can be triggered by calcium influx and oxidative stress. Calpain I and II are heterodimeric with distinct large subunits associated with common small subunits, all of which are encoded by different genes. This gene encodes a small subunit common to both calpain I and II and is associated with myotonic dystrophy. Two transcript variants encoding the same protein have been identified for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 7:30186942-30195164 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | B1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 26 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Extracellular matrix organization pathway
Degradation of the extracellular matrix pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Extracellular matrix organization pathway
Degradation of the extracellular matrix pathway
Extracellular matrix organization pathway
Degradation of the extracellular matrix pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.439782 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_009795 XM_006539488 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS21082 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||