Mus musculus Gene: Sap18 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-168943.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | Sap18 | ||||||||||||||||||
Gene Name | Sin3-associated polypeptide 18 | ||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000021963 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
Sin3-associated polypeptide 18
Sin3-associated polypeptide 18
Sin3-associated polypeptide 18
Sin3-associated polypeptide 18
Sin3-associated polypeptide 18
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Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
This intronless gene is highly similar to the multi-exon Sap18 gene on chromosome 14, whose product functions in transcriptional repression as a component of the Sin3 histone deacetylase complex. This gene may possibly be a Sap18 pseudogene, but it is represented as protein-coding because it appears to be transcribed and has an intact ORF that would result in a protein that is 100% identical to the Sap18 protein. [provided by RefSeq, Dec 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 14:57798180-57804980 | ||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||
Band | C3 | ||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 10 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||
No orthologs found for this gene | |||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||
REACTOME |
Mus musculus biological processes pathway
NoRC negatively regulates rRNA expression pathway
Chromatin organization pathway
NoRC negatively regulates rRNA expression pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
Epigenetic regulation of gene expression pathway
Gene Expression pathway
Negative epigenetic regulation of rRNA expression pathway
HDACs deacetylate histones pathway
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KEGG |
RNA transport pathway
mRNA surveillance pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
UniGene | Mm.344671 Mm.474115 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NM_009119 | ||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||
CCDS | CCDS27159 | ||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||