Mus musculus Gene: Afp | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-178564.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Afp | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | alpha fetoprotein | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000054932 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
alpha fetoprotein
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000081051:
This gene encodes alpha-fetoprotein, a major plasma protein produced by the yolk sac and the liver during fetal life. Alpha-fetoprotein expression in adults is often associated with hepatoma or teratoma. However, hereditary persistance of alpha-fetoprotein may also be found in individuals with no obvious pathology. The protein is thought to be the fetal counterpart of serum albumin, and the alpha-fetoprotein and albumin genes are present in tandem in the same transcriptional orientation on chromosome 4. Alpha-fetoprotein is found in monomeric as well as dimeric and trimeric forms, and binds copper, nickel, fatty acids and bilirubin. The level of alpha-fetoprotein in amniotic fluid is used to measure renal loss of protein to screen for spina bifida and anencephaly. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:90490714-90508907 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | E1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 5 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 13 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
FOXA2 and FOXA3 transcription factor networks
Direct p53 effectors
Glucocorticoid receptor regulatory network
p73 transcription factor network
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | P02772 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q3TGA3 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 11576 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.358570 Mm.398486 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_007423 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS19413 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:87951 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Afp | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AK010934 AK145975 AK146513 AK146524 AK167549 AK168574 AK168576 AK168751 AK168818 AK168883 AK169046 AK169054 AK169147 BC066206 M16381 M16382 M16383 M16384 M16385 M16386 M16387 M16388 M16389 M16390 M16391 M16392 M16393 M16394 V00743 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA37189 AAH66206 BAB27278 BAE26798 BAE27225 BAE27233 BAE39615 BAE40444 BAE40446 BAE40591 BAE40645 BAE40701 BAE40834 BAE40842 BAE40926 CAA24118 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 11576 | ||||||||||||||||||||||