Homo sapiens Gene: CLN6 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-18915.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | CLN6 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | ceroid-lipofuscinosis, neuronal 6, late infantile, variant | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000128973 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
ceroid-lipofuscinosis, neuronal 6, late infantile, variant
ceroid-lipofuscinosis, neuronal 6, late infantile, variant
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene is one of eight which have been associated with neuronal ceroid lipofuscinoses (NCL). Also referred to as Batten disease, NCL comprises a class of autosomal recessive, neurodegenerative disorders affecting children. The genes responsible likely encode proteins involved in the degradation of post-translationally modified proteins in lysosomes. The primary defect in NCL disorders is thought to be associated with lysosomal storage function. [provided by RefSeq, Oct 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 15:68206992-68257211 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q23 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 6 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | H3BUV4 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 54982 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.584921 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_017882 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:2077 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 606725 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS10227 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 05991 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AC107871 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 54982 | ||||||||||||||||||||||