Version 5.4
| Homo sapiens Gene: GTF3A | |||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-19126.6 | ||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
| Gene Symbol | GTF3A | ||||||||||||||||||
| Gene Name | general transcription factor IIIA | ||||||||||||||||||
| Synonyms | AP2; TFIIIA | ||||||||||||||||||
| Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
| Ensembl Gene | ENSG00000122034 | ||||||||||||||||||
| Encoded Proteins |
general transcription factor IIIA
general transcription factor IIIA
general transcription factor IIIA
general transcription factor IIIA
general transcription factor IIIA
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| Protein Structure | |||||||||||||||||||
| Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
| Entrez Gene | |||||||||||||||||||
| Summary |
The product of this gene is a zinc finger protein with nine Cis[2]-His[2] zinc finger domains. It functions as an RNA polymerase III transcription factor to induce transcription of the 5S rRNA genes. The protein binds to a 50 bp internal promoter in the 5S genes called the internal control region (ICR), and nucleates formation of a stable preinitiation complex. This complex recruits the TFIIIC and TFIIIB transcription factors and RNA polymerase III to form the complete transcription complex. The protein is thought to be translated using a non-AUG translation initiation site in mammals based on sequence analysis, protein homology, and the size of the purified protein. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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| Gene Information | |||||||||||||||||||
| Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
| Genomic Location | Chromosome 13:27424544-27435823 | ||||||||||||||||||
| Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||
| Band | q12.2 | ||||||||||||||||||
| Transcripts | |||||||||||||||||||
| Interactions | |||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 5 experimentally validated interaction(s) in this database.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Orthologs | |||||||||||||||||||
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Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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| Pathways | |||||||||||||||||||
| NETPATH | |||||||||||||||||||
| REACTOME |
RNA Polymerase III Abortive And Retractive Initiation pathway
RNA Polymerase III Transcription Initiation From Type 1 Promoter pathway
RNA Polymerase III Transcription Initiation pathway
RNA Polymerase III Transcription pathway
RNA Polymerase I, RNA Polymerase III, and Mitochondrial Transcription pathway
Gene Expression pathway
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| KEGG | |||||||||||||||||||
| INOH | |||||||||||||||||||
| PID NCI |
IL4-mediated signaling events
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| Cross-References | |||||||||||||||||||
| SwissProt | |||||||||||||||||||
| TrEMBL | |||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
| Entrez Gene | |||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.445977 | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NM_002097 | ||||||||||||||||||
| HUGO | |||||||||||||||||||
| OMIM | |||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS45019 | ||||||||||||||||||
| HPRD | 02916 | ||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||
| EMBL | |||||||||||||||||||
| GenPept | |||||||||||||||||||
| RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||