Mus musculus Gene: Gabarap | |||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-193040.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Gabarap | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | gamma-aminobutyric acid receptor associated protein | ||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000018567 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
gamma-aminobutyric acid receptor associated protein
gamma-aminobutyric acid receptor associated protein
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Protein Structure |
![]() |
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Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Gabarap deficient mice are more susceptible to sepsis due to enhanced inflammasome activation.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000170296:
Gamma-aminobutyric acid A receptors [GABA(A) receptors] are ligand-gated chloride channels that mediate inhibitory neurotransmission. This gene encodes GABA(A) receptor-associated protein, which is highly positively charged in its N-terminus and shares sequence similarity with light chain-3 of microtubule-associated proteins 1A and 1B. This protein clusters neurotransmitter receptors by mediating interaction with the cytoskeleton. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:69991143-69994951 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||
Band | B3 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 5 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 78 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Regulation of autophagy pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Regulation of autophagy pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9DCD6 | ||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 56486 | ||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.409975 | ||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_019749 | ||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS24928 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1861742 | ||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Gabarap | ||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AF161587 AK002879 AK011731 AL596185 BC002126 BC024621 BC030350 | ||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAD47642 AAH02126 AAH24621 AAH30350 BAB22426 BAB27806 CAI35162 | ||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 56486 | ||||||||||||||||||||||||||||||