Mus musculus Gene: Scn10a | |||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-204799.6 | ||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Scn10a | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | sodium channel, voltage-gated, type X, alpha | ||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Nav1.8; PN3; SNS | ||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000034533 | ||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
sodium channel, voltage-gated, type X, alpha
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000185313:
The protein encoded by this gene is a tetrodotoxin-resistant voltage-gated sodium channel alpha subunit. The properties of the channel formed by the encoded transmembrane protein can be altered by interaction with different beta subunits. This protein may be involved in the onset of pain associated with peripheral neuropathy. [provided by RefSeq, Dec 2011] The protein encoded by this gene is a tetrodotoxin-resistant voltage-gated sodium channel alpha subunit. The properties of the channel formed by the encoded transmembrane protein can be altered by interaction with different beta subunits. This protein may be involved in the onset of pain associated with peripheral neuropathy. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jun 2014] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 9:119608456-119719032 | ||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||
Band | F3 | ||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Interaction between L1 and Ankyrins pathway
L1CAM interactions pathway
Developmental Biology pathway
Axon guidance pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | K3W4P8 | ||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 20264 | ||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.247042 | ||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001205321 NM_009134 XM_006511989 XM_006511990 XM_006511991 XM_006511992 | ||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS57716 | ||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:108029 | ||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Scn10a | ||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC171201 CH466587 | ||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | EDL09206 | ||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 20264 | ||||||||||||||||||||||||||||