Mus musculus Gene: Dffa | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-204894.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Dffa | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | DNA fragmentation factor, alpha subunit | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | A330085O09Rik; DFF35; Dff45; ICAD; ICAD-L; ICAD-S | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000028974 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
DNA fragmentation factor, alpha subunit
DNA fragmentation factor, alpha subunit
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000160049:
Apoptosis is a cell death process that removes toxic and/or useless cells during mammalian development. The apoptotic process is accompanied by shrinkage and fragmentation of the cells and nuclei and degradation of the chromosomal DNA into nucleosomal units. DNA fragmentation factor (DFF) is a heterodimeric protein of 40-kD (DFFB) and 45-kD (DFFA) subunits. DFFA is the substrate for caspase-3 and triggers DNA fragmentation during apoptosis. DFF becomes activated when DFFA is cleaved by caspase-3. The cleaved fragments of DFFA dissociate from DFFB, the active component of DFF. DFFB has been found to trigger both DNA fragmentation and chromatin condensation during apoptosis. Two alternatively spliced transcript variants encoding distinct isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 4:149104146-149120647 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | E2 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 27 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Apoptosis pathway
Apoptosis induced DNA fragmentation pathway
Activation of DNA fragmentation factor pathway
Apoptotic execution phase pathway
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KEGG |
Apoptosis pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Activation of DNA fragmentation factor pathway
Apoptotic execution phase pathway
Apoptosis induced DNA fragmentation pathway
Apoptosis pathway
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KEGG |
Apoptosis pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Caspase Cascade in Apoptosis
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | O54786 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 13347 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.41433 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001025296 NM_010044 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS18951 CCDS18952 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1196227 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Dffa | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AB009375 AB009376 AK051011 AL611967 CU210839 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | BAA24140 BAA24141 BAC34496 CAM13988 CAQ52098 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 13347 | ||||||||||||||||||||||