Mus musculus Gene: Cln3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-209626.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Cln3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | ceroid lipofuscinosis, neuronal 3, juvenile (Batten, Spielmeyer-Vogt disease) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AI323623 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000030720 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
ceroid lipofuscinosis, neuronal 3, juvenile (Batten, Spielmeyer-Vogt disease)
ceroid lipofuscinosis, neuronal 3, juvenile (Batten, Spielmeyer-Vogt disease)
ceroid lipofuscinosis, neuronal 3, juvenile (Batten, Spielmeyer-Vogt disease)
ceroid lipofuscinosis, neuronal 3, juvenile (Batten, Spielmeyer-Vogt disease)
ceroid lipofuscinosis, neuronal 3, juvenile (Batten, Spielmeyer-Vogt disease)
ceroid lipofuscinosis, neuronal 3, juvenile (Batten, Spielmeyer-Vogt disease)
ceroid lipofuscinosis, neuronal 3, juvenile (Batten, Spielmeyer-Vogt disease)
ceroid lipofuscinosis, neuronal 3, juvenile (Batten, Spielmeyer-Vogt disease)
ceroid lipofuscinosis, neuronal 3, juvenile (Batten, Spielmeyer-Vogt disease)
ceroid lipofuscinosis, neuronal 3, juvenile (Batten, Spielmeyer-Vogt disease)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000188603:
This gene encodes a protein that is involved in lysosomal function. Mutations in this, as well as other neuronal ceroid-lipofuscinosis (CLN) genes, cause neurodegenerative diseases commonly known as Batten disease or collectively known as neuronal ceroid lipofuscinoses (NCLs). Many alternatively spliced transcript variants have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 7:126571207-126585817 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | F3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 44 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Lysosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Lysosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | D3YUU4 D3YVA8 D3YZN0 D3Z6L5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 12752 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.268930 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001146311 NM_009907 XM_006507289 XM_006507290 XM_006507291 XM_006507292 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS21833 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:107537 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Cln3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC125169 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 12752 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||