Mus musculus Gene: Smarce1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-210926.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Smarce1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2810417B20Rik; 5830412H02Rik; 9030408N19Rik; Baf27 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000037935 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] SMARCE1 is a transcriptional modulator that is known to repress viral replication.
[Homo sapiens] SMARCE1 is associated with up-regulation of proapoptotic genes, including the tumour suppressor familial cylindromatosis (CYLD).
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000073584:
The protein encoded by this gene is part of the large ATP-dependent chromatin remodeling complex SWI/SNF, which is required for transcriptional activation of genes normally repressed by chromatin. The encoded protein, either alone or when in the SWI/SNF complex, can bind to 4-way junction DNA, which is thought to mimic the topology of DNA as it enters or exits the nucleosome. The protein contains a DNA-binding HMG domain, but disruption of this domain does not abolish the DNA-binding or nucleosome-displacement activities of the SWI/SNF complex. Unlike most of the SWI/SNF complex proteins, this protein has no yeast counterpart. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:99209047-99231017 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | D | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 34 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 78 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Chromatin organization pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
RMTs methylate histone arginines pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH |
AndrogenReceptor pathway
TNFalpha pathway
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REACTOME |
Chromatin organization pathway
RMTs methylate histone arginines pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Validated nuclear estrogen receptor beta network
Regulation of Androgen receptor activity
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.379086 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_020618 XM_006533825 XM_006533826 XM_006533827 XM_006533828 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS25374 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||