Mus musculus Gene: Snai1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-213071.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Snai1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | snail homolog 1 (Drosophila) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AI194338; Sna; Sna1; Snail; Snail1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000042821 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
snail homolog 1 (Drosophila)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000124216:
The Drosophila embryonic protein snail is a zinc finger transcriptional repressor which downregulates the expression of ectodermal genes within the mesoderm. The nuclear protein encoded by this gene is structurally similar to the Drosophila snail protein, and is also thought to be critical for mesoderm formation in the developing embryo. At least two variants of a similar processed pseudogene have been found on chromosome 2. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:167538195-167542814 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | H3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 8 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 29 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Adherens junction pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Adherens junction pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Signaling events mediated by Hepatocyte Growth Factor Receptor (c-Met)
Validated targets of C-MYC transcriptional activation
Integrin-linked kinase signaling
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q02085 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q4FK48 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 20613 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.2093 Mm.405835 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_011427 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS17102 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:98330 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Snai1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | BC034857 CH466551 CT010204 CT010370 M95604 U95961 X67253 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA03481 AAB58054 AAH34857 CAA47675 CAJ18412 CAJ18577 EDL06519 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 20613 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||