Homo sapiens Gene: TREX1 | |||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-239077.6 | ||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | TREX1 | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | three prime repair exonuclease 1 | ||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AGS1; CRV; DRN3; HERNS | ||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000213689 | ||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
three prime repair exonuclease 1
three prime repair exonuclease 1
three prime repair exonuclease 1
three prime repair exonuclease 1
three prime repair exonuclease 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a nuclear protein with 3' exonuclease activity. The encoded protein may play a role in DNA repair and serve as a proofreading function for DNA polymerase. Mutations in this gene result in Aicardi-Goutieres syndrome, chilblain lupus, Cree encephalitis, and other diseases of the immune system. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Sep 2012] This gene encodes a nuclear protein with 3\' exonuclease activity. The encoded protein may play a role in DNA repair and serve as a proofreading function for DNA polymerase. Mutations in this gene result in Aicardi-Goutieres syndrome, chilblain lupus, Cree encephalitis, and other diseases of the immune system. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Sep 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 3:48465046-48467645 | ||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||
Band | p21.31 | ||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 7 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
STING mediated induction of host immune responses pathway
IRF3-mediated induction of type I IFN pathway
Innate Immune System pathway
Regulation of innate immune responses to cytosolic DNA pathway
Immune System pathway
Regulation by TREX1 pathway
Cytosolic sensors of pathogen-associated DNA pathway
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KEGG |
Cytosolic DNA-sensing pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.707026 Hs.713742 Hs.743501 | ||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_007248 NM_016381 NM_033629 NM_001271022 NM_001271023 NM_032166 NM_130384 | ||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS2769 CCDS59451 CCDS2767 CCDS2768 CCDS59449 CCDS59450 | ||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 09423 | ||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||