Homo sapiens Gene: RBMXL1 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-241129.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | RBMXL1 | ||||||||||||||||||
Gene Name | RNA binding motif protein, X-linked-like 1 | ||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000213516 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
RNA binding motif protein, X-linked-like 1
RNA binding motif protein, X-linked-like 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
This gene represents a retrogene of RNA binding motif protein, X-linked (RBMX), which is located on chromosome X. While all introns in the coding sequence have been processed out compared to the RBMX locus, the ORF is intact and there is specific evidence for transcription at this location. The preservation of the ORF by purifying selection in all Old World monkeys carrying it suggests that this locus is likely to be functional, possibly during male meiosis when X chromosomal genes are silenced or during haploid stages of spermatogenesis. This gene shares 5' exon structure with the cysteine conjugate-beta lyase 2 locus on chromosome 1, but the coding sequences are non-overlapping. Alternative splicing results in two transcript variants. [provided by RefSeq, Jun 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:88979456-88992960 | ||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||
Band | p22.2 | ||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||
No orthologs found for this gene | |||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||
KEGG |
Spliceosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
UniGene | Hs.481898 Hs.622650 Hs.708164 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001162536 NM_019610 | ||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||
CCDS | CCDS716 | ||||||||||||||||||
HPRD | 17417 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||