Homo sapiens Gene: NFIX | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-31627.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | NFIX | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | nuclear factor I/X (CCAAT-binding transcription factor) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | MRSHSS; NF1A; SOTOS2 | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000008441 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
nuclear factor I/X (CCAAT-binding transcription factor)
nuclear factor I/X (CCAAT-binding transcription factor)
nuclear factor I/X (CCAAT-binding transcription factor)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is a transcription factor that binds the palindromic sequence 5'-TTGGCNNNNNGCCAA-3 in viral and cellular promoters. The encoded protein can also stimulate adenovirus replication in vitro. Three transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2012] The protein encoded by this gene is a transcription factor that binds the palindromic sequence 5\'-TTGGCNNNNNGCCAA-3 in viral and cellular promoters. The encoded protein can also stimulate adenovirus replication in vitro. Three transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 19:12995608-13098796 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | p13.13 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 17 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
RNA Polymerase III Abortive And Retractive Initiation pathway
RNA Polymerase III Transcription Termination pathway
RNA Polymerase III Transcription pathway
RNA Polymerase I, RNA Polymerase III, and Mitochondrial Transcription pathway
Gene Expression pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q14938 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | K7EKH0 K7ESG9 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 4784 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.597451 Hs.619048 Hs.621701 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_002501 NM_001271043 NM_001271044 XM_006722760 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:7788 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 164005 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS45996 CCDS59359 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 01234 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AC004660 AC007787 AC022152 AC138474 AK297261 BC117113 BC117115 BT019732 CH471106 L31881 U07811 U18759 U18761 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA53422 AAA93126 AAB52369 AAB52371 AAC15752 AAD38240 AAD38241 AAI17114 AAI17116 AAV38537 BAG59737 EAW84340 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 4784 | ||||||||||||||||||||||