Homo sapiens Gene: TRIM56 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-32956.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | TRIM56 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | tripartite motif containing 56 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000169871 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
tripartite motif containing 56
tripartite motif containing 56
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||
Summary |
TRIM56 is a regulator of double-stranded DNA-mediated type I interferon induction where it acts as an interferon-inducible E3 ubiquitin ligase that modulates STING to confer double-stranded DNA-mediated innate immune responses.
TRIM56 is an anti-viral host factor that restricts pestivirus infection, specifically it was found to impair bovine viral diarrhoea virus replication.
TRIM56 is an essential component of the TLR3 anti-viral signalling pathway.
TRIM56 was identified in a systematic screen for positive regulators of innate immune responses.
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InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Summary |
[Mus musculus] Trim56 is an anti-viral host factor that restricts pestivirus infection, specifically it was found to impair bovine viral diarrhoea virus replication.
[Mus musculus] TRIM56 is an essential component of the TLR3 anti-viral signalling pathway. (Demonstrated in human)
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary | Currently no Entrez Summary Available. You might want to check the Summary Sections of the Orthologs. | ||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 7:101085439-101091736 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q22.1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 12 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Innate Immune System pathway
Regulation of innate immune responses to cytosolic DNA pathway
Immune System pathway
Cytosolic sensors of pathogen-associated DNA pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.521092 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_030961 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS43625 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 10284 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||