Homo sapiens Gene: SETDB2 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-33315.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | SETDB2 | ||||||||||||||||||
Gene Name | SET domain, bifurcated 2 | ||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000136169 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
SET domain, bifurcated 2
SET domain, bifurcated 2
SET domain, bifurcated 2
SET domain, bifurcated 2
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Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
Proteins that contain a SET domain, such as SETDB2, modulate gene expression epigenetically through histone H3 (see MIM 601128) methylation. SETDB2 is likely a histone H3 methyltransferase, as it contains both the active site and flanking cysteine residues required for catalytic activity (Zhang et al., 2003 [PubMed 12754510]).[supplied by OMIM, Mar 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 13:49444374-49495003 | ||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||
Band | q14.2 | ||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||
KEGG |
Lysine degradation pathway
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INOH | |||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001160308 NM_031915 XM_005266568 XM_005266570 | ||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||
CCDS | CCDS53868 CCDS9417 | ||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||