Version 5.4
| Homo sapiens Gene: SF3B14 | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Summary | |||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-33356.7 | ||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
| Gene Symbol | SF3B14 | ||||||||||||||||||
| Gene Name | Pre-mRNA branch site protein p14 | ||||||||||||||||||
| Synonyms | |||||||||||||||||||
| Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
| Ensembl Gene | ENSG00000115128 | ||||||||||||||||||
| Encoded Proteins |
Pre-mRNA branch site protein p14
|
||||||||||||||||||
| Protein Structure |
|
||||||||||||||||||
| Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
| Entrez Gene | |||||||||||||||||||
| Summary |
This gene encodes a 14 kDa protein subunit of the splicing factor 3b complex. Splicing factor 3b associates with both the U2 and U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein complexes (U2 snRNP) of spliceosomes. This 14 kDa protein interacts directly with subunit 1 of the splicing factor 3b complex. This 14 kDa protein also interacts directly with the adenosine that carries out the first transesterification step of splicing at the pre-mRNA branch site. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
||||||||||||||||||
| Gene Information | |||||||||||||||||||
| Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
| Genomic Location | Chromosome 2:24067584-24076443 | ||||||||||||||||||
| Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||
| Band | p23.3 | ||||||||||||||||||
| Transcripts |
|
||||||||||||||||||
| Interactions | |||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 68 experimentally validated interaction(s) in this database.
|
||||||||||||||||||
| Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||
| Biological Process |
|
||||||||||||||||||
| Cellular Component |
|
||||||||||||||||||
| Orthologs | |||||||||||||||||||
|
Species
Mus musculus
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||
| Pathways | |||||||||||||||||||
| NETPATH | |||||||||||||||||||
| REACTOME |
mRNA Splicing - Major Pathway pathway
mRNA Splicing - Minor Pathway pathway
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA pathway
mRNA Splicing pathway
Gene Expression pathway
|
||||||||||||||||||
| KEGG |
Spliceosome pathway
|
||||||||||||||||||
| INOH | |||||||||||||||||||
| PID NCI | |||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||
| SwissProt | Q9Y3B4 | ||||||||||||||||||
| TrEMBL | |||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
| Entrez Gene | 51639 | ||||||||||||||||||
| UniGene | |||||||||||||||||||
| RefSeq | NM_016047 | ||||||||||||||||||
| HUGO | HGNC:30096 | ||||||||||||||||||
| OMIM | 607835 | ||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS1707 | ||||||||||||||||||
| HPRD | 09702 | ||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||
| EMBL | AC008073 AF151868 AF161523 AF184213 AF401310 AK311908 BC015463 CH471053 | ||||||||||||||||||
| GenPept | AAD34105 AAF29138 AAG09698 AAH15463 AAK94041 AAY14664 BAG34849 EAX00767 | ||||||||||||||||||
| RNA Seq Atlas | 51639 | ||||||||||||||||||