Homo sapiens Gene: GPR56 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-33507.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | GPR56 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | G protein-coupled receptor 56 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | BFPP; BPPR; TM7LN4; TM7XN1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000205336 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
G protein-coupled receptor 56
G protein-coupled receptor 56
G protein-coupled receptor 56
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a member of the G protein-coupled receptor family. The protein contains 7 transmembrane domains and a mucin-like domain in the N-terminal region. The gene is implicated in the regulation of brain cortical patterning. The protein binds specifically to transglutaminase 2 in the extracellular space. Expression of this gene is downregulated in melanoma cell lines, and overexpression of this gene can suppress tumor growth and metastasis. Mutations in this gene result in bilateral frontoparietal polymicrogyria. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Mar 2009] This gene encodes a member of the G protein-coupled receptor family and regulates brain cortical patterning. The encoded protein binds specifically to transglutaminase 2, a component of tissue and tumor stroma implicated as an inhibitor of tumor progression. Mutations in this gene are associated with a brain malformation known as bilateral frontoparietal polymicrogyria. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Feb 2014] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 16:57610652-57665580 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 6 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | H3BNN3 H3BQW4 H3BRA1 H3BRB4 H3BS14 H3BSN3 H3BSN7 H3BSR1 H3BT88 H3BTD2 H3BTK9 H3BV72 H3BVE9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 9289 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.513633 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001145770 NM_001145771 NM_001145772 NM_001145773 NM_001145774 NM_001290143 NM_001290144 NM_005682 NM_201524 NM_201525 XM_005256237 XM_005256238 XM_005256239 XM_005256240 XM_005256241 XM_005256242 XM_005256243 XM_005256244 XM_005256245 XM_005256246 XM_005256247 XM_005256248 XM_005256249 XM_005256251 XM_005256252 XM_005256253 XM_005256254 XM_005256255 XM_006721338 XM_006721339 XM_006721340 XM_006721341 XM_006721342 XM_006721343 XM_006721344 XM_006721345 XM_006721346 XM_006721347 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:4512 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 604110 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS32460 CCDS32461 CCDS73893 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 06824 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC018552 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 9289 | ||||||||||||||||||||||||||||||||