Version 5.4
| Homo sapiens Gene: SLC6A5 | |||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-35956.6 | ||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
| Gene Symbol | SLC6A5 | ||||||||||||||||||
| Gene Name | solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, glycine), member 5 | ||||||||||||||||||
| Synonyms | GLYT-2; GLYT2; HKPX3; NET1 | ||||||||||||||||||
| Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
| Ensembl Gene | ENSG00000165970 | ||||||||||||||||||
| Encoded Proteins |
solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, glycine), member 5
solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, glycine), member 5
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| Protein Structure |
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| Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
| Entrez Gene | |||||||||||||||||||
| Summary |
This gene encodes a sodium- and chloride-dependent glycine neurotransmitter transporter. This integral membrane glycoprotein is responsible for the clearance of extracellular glycine during glycine-mediated neurotransmission. This protein is found in glycinergic axons and maintains a high presynaptic pool of neurotransmitter at glycinergic synapses. Mutations in this gene cause hyperekplexia; a heterogenous neurological disorder characterized by exaggerated startle responses and neonatal apnea. [provided by RefSeq, Oct 2009] |
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| Gene Information | |||||||||||||||||||
| Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
| Genomic Location | Chromosome 11:20599400-20659285 | ||||||||||||||||||
| Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||
| Band | p15.1 | ||||||||||||||||||
| Transcripts |
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| Interactions | |||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Orthologs | |||||||||||||||||||
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Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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| Pathways | |||||||||||||||||||
| NETPATH | |||||||||||||||||||
| REACTOME |
Na+/Cl- dependent neurotransmitter transporters pathway
Transport of glucose and other sugars, bile salts and organic acids, metal ions and amine compounds pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
SLC-mediated transmembrane transport pathway
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| KEGG | |||||||||||||||||||
| INOH | |||||||||||||||||||
| PID NCI | |||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||
| SwissProt | Q9Y345 | ||||||||||||||||||
| TrEMBL | J3KNC4 | ||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
| Entrez Gene | 9152 | ||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.136557 Hs.530715 Hs.557957 | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NM_004211 XM_005253225 | ||||||||||||||||||
| HUGO | HGNC:11051 | ||||||||||||||||||
| OMIM | 604159 | ||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS7854 | ||||||||||||||||||
| HPRD | |||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||
| EMBL | AC090707 AF085412 AF117999 AF142501 AF352733 BC096319 | ||||||||||||||||||
| GenPept | AAC95145 AAD27892 AAH96319 AAK12641 AAK29670 | ||||||||||||||||||
| RNA Seq Atlas | 9152 | ||||||||||||||||||