Homo sapiens Gene: RAG1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-40149.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RAG1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | recombination activating gene 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | RAG-1; RNF74 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000166349 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
recombination activating gene 1
recombination activating gene 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Rag1 knockout mice display deficient early inflammatory responses and reduced survival during sepsis, which demonstrates a novel role of B cells in the early innate immune response. (Demonstrated in mice)
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InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Mus musculus] Rag1 knockout mice display deficient early inflammatory responses and reduced survival during sepsis, which demonstrates a novel role of B cells in the early innate immune response.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is involved in activation of immunoglobulin V-D-J recombination. The encoded protein is involved in recognition of the DNA substrate, but stable binding and cleavage activity also requires RAG2. Defects in this gene can be the cause of several diseases. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:36510709-36593156 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 29 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 6 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Primary immunodeficiency pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.677010 Hs.714925 Hs.73958 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_000448 XM_005253041 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS7902 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 01556 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||