Homo sapiens Gene: TLR9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-407857.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | TLR9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | toll-like receptor 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000239732 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
toll-like receptor 9
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
TLR9 acts as a receptor for unmethylated CpG-DNA and bacterial DNA to initiate a variety of immune responses.
TLR9 recognizes unmethylated DNA with CpG-motifs and the LR9 mediated signalling pathway is not only responsible for activation of innate immune cells, but also for mounting acquired responses.
TLR9, 8 and 7 form a functional subgroup within the TLR family that recognizes pathogen-associated molecular patterns in endosomal/lysosomal compartments.
TLR9 acts at the cell surface and engages an intracellular signalling pathway that includes MyD88, IRAK, and TRAF6.
TLR9/7-mediated innate immune responses are negatively regulated via selected TLR pathways by a human microsatellite DNA-mimicking oligodeoxynucleotide with CCT repeats.
TLR9 and TLR4 have both non-redundant and cooperative roles in lung innate responses during Gram-negative bacterial pneumonia and are both critical for IL-17 driven antibacterial host response.
TLR9 ectodomain is cleaved to generate a functional receptor; although both the full-length and cleaved forms of TLR9 are capable of binding ligand, only the processed form recruits MyD88 on activation, indicating that this truncated receptor, rather than the full-length form, is functional.
TLR9 signalling enhances the rate of acidification of Salmonella-containing phagosomes, and this acidification induces the expression of Salmonella pathogenecity genes that are necessary for intracellular survival, growth, and systemic infection. TLR9 deficiency rescues the high Salmonella susceptibility phenotype observed in TLR2,TLR4 double mutant mice . (Demonstrated in murine model)
TLR9 triggers plasmacytoid dendritic cells in Systemic Lupus Erythematosus patients upon recognition of self-antigens such as neutrophil extracellular traps (NETs).
TLR9 requires proteolytic processing in endolysosome by asparagine endopeptidase and cathepsin in the endolysosome to initiate signalling in response to DNA. (Demonstrated in murine model)
TLR9 deficiency reduced pancreatic edema, inflammation and pro-IL1B expression in pacreatitis. (Demonstrated in murine model)
TLR9 synergistically interacts with TLR2::TLR6 in lung epithelium to induce rapid pathogen killing, and can be used as a therapeutic target to treat otherwise lethal pneumonia.
TLR9 is proteolytically cleaved in the endosome to form a soluble TLR9 (sTLR9), which inhibits TLR9-dependent signalling and contributes to the prevention of autoimmune disease.
TLR9 activation is enhanced by increased levels of circulating histones, serving as a crucial link between initial damage and activation of innate immunity during sterile inflammation. (Demonstrated in murine model)
TLR9 promotes macrophage HIF1A levels, oxidative burst and nitric oxide production in response to group A Streptococcus (GAS), contributing to GAS clearance in vivo in both localized cutaneous and systemic infection models. (Demonstrated in murine model)
TLR9 is selectively compartmentalized to fungal phagosomes and negatively modulates macrophage anti-fungal effector functions. (Demonstrated in mice)
TLR9 expression and signalling capacity oscillate with the circadian clock. (Demonstrated in mice)
Mitochondrial DNA that escapes from autophagy induces TLR9 inflammatory responses in cardiomyocytes and is capable of inducing myocarditis and dilated cardiomyopathy. (Demonstrated in mice)
TLR9 activation by endogenous self-ligands generated during oxidative stress promotes platelet hyper-reactivity and thrombosis.
Human papillomavirus E7 protein forms a transcriptionally repressive complex over the promoter of TLR9 to suppress the interferon response.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is a member of the Toll-like receptor (TLR) family which plays a fundamental role in pathogen recognition and activation of innate immunity. TLRs are highly conserved from Drosophila to humans and share structural and functional similarities. They recognize pathogen-associated molecular patterns (PAMPs) that are expressed on infectious agents, and mediate the production of cytokines necessary for the development of effective immunity. The various TLRs exhibit different patterns of expression. This gene is preferentially expressed in immune cell rich tissues, such as spleen, lymph node, bone marrow and peripheral blood leukocytes. Studies in mice and human indicate that this receptor mediates cellular response to unmethylated CpG dinucleotides in bacterial DNA to mount an innate immune response. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 3:52221080-52226163 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p21.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 45 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
No orthologs found for this gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
TRAF6 mediated IRF7 activation in TLR7/8 or 9 signaling pathway
TRAF6 mediated induction of NFkB and MAP kinases upon TLR7/8 or 9 activation pathway
MyD88 dependent cascade initiated on endosome pathway
Toll Like Receptor 9 (TLR9) Cascade pathway
Trafficking and processing of endosomal TLR pathway
PI3K Cascade pathway
Signaling by Insulin receptor pathway
IRS-related events triggered by IGF1R pathway
Signaling by Type 1 Insulin-like Growth Factor 1 Receptor (IGF1R) pathway
Toll Like Receptor 7/8 (TLR7/8) Cascade pathway
Innate Immune System pathway
Toll-Like Receptors Cascades pathway
Signal Transduction pathway
IRS-mediated signalling pathway
Immune System pathway
Insulin receptor signalling cascade pathway
IRS-related events pathway
IGF1R signaling cascade pathway
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KEGG |
Toll-like receptor signaling pathway pathway
Malaria pathway
Chagas disease (American trypanosomiasis) pathway
African trypanosomiasis pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.87968 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_017442 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS2848 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 05685 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||