Version 5.4
| Homo sapiens Gene: IL28B | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Summary | |||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-50088.6 | ||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
| Gene Symbol | IL28B | ||||||||||||||||||
| Gene Name | interleukin 28B (interferon, lambda 3) | ||||||||||||||||||
| Synonyms | |||||||||||||||||||
| Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
| Ensembl Gene | ENSG00000197110 | ||||||||||||||||||
| Encoded Proteins |
interleukin 28B (interferon, lambda 3)
interferon, lambda 3
|
||||||||||||||||||
| Protein Structure |
|
||||||||||||||||||
| Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
| InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||
| Summary |
IFNL1, IFNL2 and IFNL3 (IL28B) have different effects on Toll-like receptor-related gene expression in HepG2 cells.
The IFNL3 SNP rs4803217 is critical for the outcome of
hepatitis C virus (HCV) infec¬tion by controlling the stability of IFNL3 mRNA. HCV induces two microRNAs, MIR499A and MIR208B, that target the polymorphic region of the IFNL3 3� UTR.
|
||||||||||||||||||
| Entrez Gene | |||||||||||||||||||
| Summary |
This gene encodes a cytokine distantly related to type I interferons and the IL-10 family. This gene, interleukin 28A (IL28A), and interleukin 29 (IL29) are three closely related cytokine genes that form a cytokine gene cluster on a chromosomal region mapped to 19q13. Expression of the cytokines encoded by the three genes can be induced by viral infection. All three cytokines have been shown to interact with a heterodimeric class II cytokine receptor that consists of interleukin 10 receptor, beta (IL10RB) and interleukin 28 receptor, alpha (IL28RA). [provided by RefSeq, Jul 2008] |
||||||||||||||||||
| Gene Information | |||||||||||||||||||
| Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
| Genomic Location | Chromosome 19:39243553-39245129 | ||||||||||||||||||
| Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||
| Band | q13.2 | ||||||||||||||||||
| Transcripts |
|
||||||||||||||||||
| Interactions | |||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 11 experimentally validated interaction(s) in this database.
|
||||||||||||||||||
| Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||
| Biological Process |
|
||||||||||||||||||
| Cellular Component |
|
||||||||||||||||||
| Orthologs | |||||||||||||||||||
| No orthologs found for this gene | |||||||||||||||||||
| Pathways | |||||||||||||||||||
| NETPATH | |||||||||||||||||||
| REACTOME | |||||||||||||||||||
| KEGG |
Cytokine-cytokine receptor interaction pathway
Jak-STAT signaling pathway pathway
|
||||||||||||||||||
| INOH | |||||||||||||||||||
| PID NCI | |||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||
| SwissProt | Q8IZI9 | ||||||||||||||||||
| TrEMBL | |||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
| Entrez Gene | 282617 | ||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.406744 | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NM_172139 XM_005258765 | ||||||||||||||||||
| HUGO | HGNC:18365 | ||||||||||||||||||
| OMIM | 607402 | ||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS12530 | ||||||||||||||||||
| HPRD | |||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||
| EMBL | AC011445 AY129149 AY184374 AY336714 AY336717 BC130314 BC130316 | ||||||||||||||||||
| GenPept | AAI30315 AAI30317 AAN28264 AAN86127 AAQ01561 AAR24509 | ||||||||||||||||||
| RNA Seq Atlas | 282617 | ||||||||||||||||||