Homo sapiens Gene: PAFAH1B3 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-54065.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PAFAH1B3 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | platelet-activating factor acetylhydrolase 1b, catalytic subunit 3 (29kDa) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | PAFAHG | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000079462 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
platelet-activating factor acetylhydrolase 1b, catalytic subunit 3 (29kDa)
platelet-activating factor acetylhydrolase 1b, catalytic subunit 3 (29kDa)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes an acetylhydrolase that catalyzes the removal of an acetyl group from the glycerol backbone of platelet-activating factor. The encoded enzyme is a subunit of the platelet-activating factor acetylhydrolase isoform 1B complex, which consists of the catalytic beta and gamma subunits and the regulatory alpha subunit. This complex functions in brain development. A translocation between this gene on chromosome 19 and the CDC-like kinase 2 gene on chromosome 1 has been observed, and was associated with mental retardation, ataxia, and atrophy of the brain. Alternatively spliced transcript variants have been described. [provided by RefSeq, Mar 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 19:42297033-42303546 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q13.2 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 46 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 3 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Ether lipid metabolism pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Lissencephaly gene (LIS1) in neuronal migration and development
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001145939 NM_001145940 NM_002573 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS12602 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 04354 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||