Version 5.4
| Homo sapiens Gene: SNRNP27 | |||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-55069.6 | ||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
| Gene Symbol | SNRNP27 | ||||||||||||||||||
| Gene Name | small nuclear ribonucleoprotein 27kDa (U4/U6.U5) | ||||||||||||||||||
| Synonyms | |||||||||||||||||||
| Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
| Ensembl Gene | ENSG00000124380 | ||||||||||||||||||
| Encoded Proteins |
small nuclear ribonucleoprotein 27kDa (U4/U6.U5)
small nuclear ribonucleoprotein 27kDa (U4/U6.U5)
small nuclear ribonucleoprotein 27kDa (U4/U6.U5)
small nuclear ribonucleoprotein 27kDa (U4/U6.U5)
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| Protein Structure | |||||||||||||||||||
| Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
| Entrez Gene | |||||||||||||||||||
| Summary |
This gene encodes a serine/arginine-rich (SR) protein. SR proteins play important roles in pre-mRNA splicing by facilitating the recognition and selection of splice sites. The encoded protein associates with the 25S U4/U6.U5 tri-snRNP, a major component of the U2-type spiceosome. The expression of this gene may be altered in cells infected with the human T-cell lymphotropic virus type 1 (HTLV-1) retrovirus. A pseudogene of this gene is located on the long arm of chromosome 5. Alternatively spliced transcript variants have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Feb 2011] |
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| Gene Information | |||||||||||||||||||
| Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
| Genomic Location | Chromosome 2:69893560-69905575 | ||||||||||||||||||
| Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||
| Band | p13.3 | ||||||||||||||||||
| Transcripts |
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| Interactions | |||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 9 experimentally validated interaction(s) in this database.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Orthologs | |||||||||||||||||||
| No orthologs found for this gene | |||||||||||||||||||
| Pathways | |||||||||||||||||||
| NETPATH | |||||||||||||||||||
| REACTOME | |||||||||||||||||||
| KEGG |
Spliceosome pathway
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| INOH | |||||||||||||||||||
| PID NCI | |||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||
| SwissProt | |||||||||||||||||||
| TrEMBL | B8ZZ98 | ||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
| Entrez Gene | 11017 | ||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.54649 Hs.712944 | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NM_006857 | ||||||||||||||||||
| HUGO | HGNC:30240 | ||||||||||||||||||
| OMIM | |||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS33219 | ||||||||||||||||||
| HPRD | 15288 | ||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||
| EMBL | AC019206 | ||||||||||||||||||
| GenPept | |||||||||||||||||||
| RNA Seq Atlas | 11017 | ||||||||||||||||||