Homo sapiens Gene: CBX1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-56608.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | CBX1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | chromobox homolog 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | CBX; HP1-BETA; HP1Hs-beta; HP1Hsbeta; M31; MOD1; p25beta | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000108468 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
chromobox homolog 1
chromobox homolog 1
chromobox homolog 1
chromobox homolog 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a highly conserved nonhistone protein, which is a member of the heterochromatin protein family . The protein is enriched in the heterochromatin and associated with centromeres. The protein has a single N-terminal chromodomain which can bind to histone proteins via methylated lysine residues, and a C-terminal chromo shadow-domain (CSD) which is responsible for the homodimerization and interaction with a number of chromatin-associated nonhistone proteins. The protein may play an important role in the epigenetic control of chromatin structure and gene expression. Several related pseudogenes are located on chromosomes 1, 3, and X. Multiple alternatively spliced variants, encoding the same protein, have been identified. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 17:48070052-48101521 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q21.32 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 83 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 12 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | P83916 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | B5MD17 C9JWS9 J3KS05 K7ELA4 Q6IBN6 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 10951 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.712805 Hs.77254 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001127228 NM_006807 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:1551 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 604511 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS11525 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AC004477 AC006468 AK312615 BC002609 BC021302 CH471109 CR456766 U35451 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAB81548 AAH02609 AAH21302 BAG35502 CAG33047 EAW94758 EAW94759 EAW94760 EAW94761 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 10951 | ||||||||||||||||||||||