Bos taurus Gene: NR1I2 | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-632805.3 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | NR1I2 | ||||||||||||||||||||||||
Gene Name | nuclear receptor subfamily 1 group I member 2 | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000019557 | ||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
nuclear receptor subfamily 1 group I member 2
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000144852:
This gene product belongs to the nuclear receptor superfamily, members of which are transcription factors characterized by a ligand-binding domain and a DNA-binding domain. The encoded protein is a transcriptional regulator of the cytochrome P450 gene CYP3A4, binding to the response element of the CYP3A4 promoter as a heterodimer with the 9-cis retinoic acid receptor RXR. It is activated by a range of compounds that induce CYP3A4, including dexamethasone and rifampicin. Several alternatively spliced transcripts encoding different isoforms, some of which use non-AUG (CUG) translation initiation codon, have been described for this gene. Additional transcript variants exist, however, they have not been fully characterized. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:65205811-65238596 | ||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 30 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Nuclear Receptor transcription pathway pathway
Gene Expression pathway
Generic Transcription Pathway pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | A2VDU4 Q5S1S2 | ||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 493713 | ||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.35993 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001103226 | ||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
EMBL | AY789647 BC133405 DAAA02001548 | ||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI33406 AAV63557 | ||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 493713 | ||||||||||||||||||||||||