Bos taurus Gene: BT.98842 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-633641.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | BT.98842 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | DNA mismatch repair protein Msh6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000001424 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
Uncharacterized protein
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000116062:
This gene encodes a protein similar to the MutS protein. In E. coli, the MutS protein helps in the recognition of mismatched nucleotides, prior to their repair. A highly conserved region of approximately 150 aa, called the Walker-A adenine nucleotide binding motif, exists in MutS homologs. The encoded protein of this gene combines with MSH2 to form a mismatch recognition complex that functions as a bidirectional molecular switch that exchanges ADP and ATP as DNA mismatches are bound and dissociated. Mutations in this gene have been identified in individuals with hereditary nonpolyposis colon cancer (HNPCC) and endometrial cancer. [provided by RefSeq, Jul 2008] This gene encodes a member of the DNA mismatch repair MutS family. In E. coli, the MutS protein helps in the recognition of mismatched nucleotides prior to their repair. A highly conserved region of approximately 150 aa, called the Walker-A adenine nucleotide binding motif, exists in MutS homologs. The encoded protein heterodimerizes with MSH2 to form a mismatch recognition complex that functions as a bidirectional molecular switch that exchanges ADP and ATP as DNA mismatches are bound and dissociated. Mutations in this gene may be associated with hereditary nonpolyposis colon cancer, colorectal cancer, and endometrial cancer. Transcripts variants encoding different isoforms have been described. [provided by RefSeq, Jul 2013] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:29968150-29989441 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 53 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Mismatch repair (MMR) directed by MSH2:MSH6 (MutSalpha) pathway
Mismatch Repair pathway
DNA Repair pathway
DNA Repair pathway
Mismatch Repair pathway
Mismatch repair (MMR) directed by MSH2:MSH6 (MutSalpha) pathway
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KEGG |
Colorectal cancer pathway
Mismatch repair pathway
Pathways in cancer pathway
Colorectal cancer pathway
Mismatch repair pathway
Pathways in cancer pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | E1B9Q4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 540526 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001192737 XM_005212664 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:7329 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | DAAA02030744 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 540526 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||